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Atelier Galaxy COMPLET depuis le 4 avril

Atelier 1: Initiation au traitement et à l'analyse des données métabolomiques sur la plateforme Galaxy IFB-MetaboHUB.

Personnes encadrant ou intervenant dans la formation :

  • PF INRA PFEM-MetaboHUB  – M. Landi / C. Duperier / M. Petera / F. Giacomoni. 
  • CEA, LIST-MetaboHUB  – E. Thévenot.
  • PF INRA Métabolome Bordeaux - MetaboHUB – D. Jacob.
  • PF INRA AXIOM - MetaboHUB –M Tremblay-Franco / JF. Martin.
  • PF CNRS ABIMS - IFB – G Le Corguillé / M Monsoor / Ch. Caron.

Public envisagé et les prérequis :

  • Public : L'atelier s'adresse en priorité aux expérimentateurs souhaitant analyser leurs données ; les modules de traitement actuellement implémentés concernent uniquement les données LC-MS mais les modules d'analyses statistiques peuvent également s'étendre aux données de RMN. Il peut également être l'occasion pour les développeurs de scripts informatiques de connaître les possibilités offertes par la plateforme web Galaxy.
  • Prérequis : Connaissances de base sur les étapes du traitement et de l'analyse des données métabolomiques.

Objectif de la formation :

Formation de la communauté des métabolomiciens à l'utilisation de la plateforme web Galaxy de traitement, d'analyse statistique et d'annotation des données développée conjointement par l'Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l'Infrastructure Nationale de Métabolomique (MetaboHUB).

Compétences acquises à la sortie de la formation :

  • Utilisation de premier niveau de la plateforme web Galaxy et connaissance de ses fonctionnalités de gestion de workflows.
  • Enchaînement des étapes de traitement et d'analyse sur la plateforme Galaxy de l'IFB-MetaboHUB.

Durée de la formation : 3 heures

Date et Lieu: Lundi 19 mai 2014 de 10h à 13h, salle informatique sur le site des 8 JS RFMF Campus INSA, Villeurbanne.

Nombre de places max: 30 

Rédaction : CDe, F Giacomoni
Date de création : 26 mars 2014
Mise à jour : 04 avril 2014
Contact : rfmf@bordeaux.inra.fr